AFATEKs bestyrelse er sammensat således:

• Direktør Ivar Green-Paulsen,
  I/S Vestforbrænding, Formand
• Direktør Tonny Juul Jensen,
  I/S Nordforbrænding, Næstformand
• Direktør John Kusz,
  I/S AffaldPlus, Bestyrelsesmedlem
• Direktør Thorkild Jørgensen,
  I/S KARA/NOVEREN, Bestyrelsesmedlem
• Direktør Hans Erik Jensen,
  I/S REFA, Bestyrelsesmedlem

Administrende direktør i AFATEK: Jens Kallesøe.